چکیده

غالبا پیچیدگی شبکه های تنظیمی بیولوژیکی، درک مستقیم زیست­شناسان را دچار مشکل می سازد و نیاز به روش های ریاضی مناسب جهت مدل­سازی ساختار آن شبکه ها و همچنین تعیین ویژگی های پویایی(دینامیکی) شبکه ها را هویدا می سازد. یکی از رهیافت های کیفی، شامل مدل سازی شبکه های تنظیمی بر حسب معادلات منطقی است.( یا با استفاده از بولین(Boolean) و یا با استفاده از گسسته سازی چند سطحی). چه از نقطه نظر کیفی و چه از نقطه نظر کمی، فرمالیسم شبکه پتری (PN)، چهارچوب تکمیلی ای جهت آنالیز پویایی(دینامیکی) سیستم های بزرگ، عرضه می نماید.

پیشنهاد ما شامل تبیین رهیافت منطقی با فرمالیسم PN می باشد. در کار قبلی، پیشتر بازنویسی سیستماتیکی از مدل های تنظیمی بولین را در یک فرمالیسیم PN استاندارد، تعریف نمودیم. در این مقاله، نگاشت سیستماتیک و دقیقی از مدل های تنظیمی منطقی چندسطحی را در شبکه های پتری استاندارد معینی، پیشنهاد می کنیم که شبکه های پتری تنظیمی چند سطحی نامیده می شوند (MRPN). بعلاوه برخی استراتژی هیا کاهش را پیشنهاد می نماییم. نهایتا، مدل های حاصله جوابگوی آنالیزهای محاسباتی و جبری استفاده شده توسط انجمن PN می گردد.

جهت روشن­ سازی رهیافتمان، رهیافتمان را به یک مدل منطقی چند سطحیِ کنترل سوئیچ ژنتیکیِ تصمیم گیری لیزوژنی (lysis-lysogeny) در باکتریوفاژ لامبدا (lambda bacteriophage)، اعمال کردیم.

فهرست مطالب

1-مقدمه

2-گراف های تنظیمی منطقی

3-شبکه های پتری تنظیمی  چند سطحی

4-مدل سازی شبکه پتری تنظیمی چند سطحی از شبکه ژنتیکِ کنترل کننده ی تصمیم گیری لیزوژنی در باکتریفاژل لامبدا

5-بحث، نتیجه گیری و چشم انداز

6-مراجع

میتوانید از لینک ابتدای صفحه، مقاله انگلیسی را رایگان دانلود فرموده و چکیده انگلیسی و سایر بخش های مقاله را مشاهده فرمایید.