Abstract
The advent of electronic healthcare records (EHR) systems has triggered the need for their semantic interoperability, which is reinforced by the opportunities for the secondary use of EHR data. The joint use of EHR standards and semantic resources has been identified as key for semantic interoperability. To date, existing tools focused on EHR standards permit to create, search, explore clinical models and to map data sources to clinical models, but do not provide an appropriate support and integration of semantic resources or permit the secondary use of EHR data. In this paper we describe an OWL-based framework that leverages EHR and Semantic Web technologies for the interoperability and exploitation of archetypes, EHR data and ontologies. It also enables the secondary use of clinical data. This framework has been implemented in the Archetype Management System (ArchMS). We also describe how ArchMS has been used in a real study in the colorectal cancer domain
چکیده
ظهور سیستمهای پرونده الکترونیک سلامت (EHR) باعث گردیده که قابلیت همکاری یا تعامل پذیری معنایی در بین این سیستمها ضرورت پیدا نماید و لذا این کار به مدد فرصتهایی که در استفاده ثانویه از دادههای EHR وجود دارد صورت میگیرد. استفادهی مشترک از استانداردهای EHR و منابع معنایی را میتوان یکی از عوامل کلیدی برای دستیابی به تعامل پذیری معنایی دانست. ابزارهایی که تا به امروز برای ایجاد، جستجو و کاوش در مدلهای بالینی و همچنین نگاشت منابع دادهای بر روی مدلهای بالینی توسعه یافتهاند، بیشتر بر روی استانداردهای EHR متمرکز بودهاند ولی با این حال، این ابزارها نتوانستهاند از ادغام منابع معنایی و یا استفادهی ثانویه از دادههای EHR پشتیبانی نمایند. در این مقاله قصد داریم به تشریح یک چارچوب مبتنی بر وب معنایی بپردازیم، به طوری که این چارچوب از فناوریهای وب معنایی و EHR استفاده نموده تا به قابلیت تعامل پذیری و بهرهبرداری از کهن الگوهای ( آرکی تایپ ها) موجود در دادههای EHR و طبقهبندی آنها دست پیدا کند. این چارچوب میتواند از دادههای بالینی نیز استفادهی ثانویه به عمل آورد. از سیستم مدیریت آرکی تایپ (ArchMS) برای پیادهسازی این چارچوب استفاده گردیده است. در ادامه، به تشریح چگونگی استفاده از ArchMS در دامنهی سرطان رودهی برگ خواهیم پرداخت.
1-مقدمه
افزایش سطح استفاده از پروندههای الکترونیک سلامت (EHR) در سطح دنیا منجر به بروز شرایطی گردیده که در آن، دادههای مربوط به سلامتی بیماران بر روی چندین سیستم بهداشت و درمان مختلف قرار میگیرد. در این شرایط نیاز است تا اطلاعات بالینی از نظر معنایی با هم همکاری و تعامل داشته باشند، بدین معنا که باید ارتباطات معناداری در بین سیستمهای EHR شکل گیرد. فقدان یک چنین همکاری و تعامل را میتوان یکی از دلایل ناکارآمدی سیستمهای بهداشت و درمان و به موجب آن، اتلاف میلیونها دلار سرمایه به صورت سالیانه در ایالت متحده دانست...