Abstract
Computer aided diagnosis in cancer pathology (computational pathology) using histological images of biopsies is an emerging field. Segmentation of cell nuclei can be an important step in such image processing pipelines. Although seeded watershed segmentation is a simple and computationally efficient segmentation technique, it is prone to errors like oversegmentation when applied to histological images. We report specific enhancements to this technique to improve segmentation of cell nuclei in histological images. Foreground seeds were generated by fast radial symmetry transform (FRST). Otsu thresholding was used on enhanced image to estimate tentative foreground map. Background markers were computed from the tentative foreground map. False detections in the segmented output were removed by logical AND with the tentative foreground map. Using these enhancements nuclear segmentation was significantly improved on histological images (H&E stained breast and intestinal tissue images, Feulgen stained images of prostate tissues
چکیده
تشخیص آسیب شناسی سرطان به کمک کامپیوتر (آسیب شناسی محاسباتی) و با استفاده از تصاویر بافت شناسی نمونه ، زمینه ای در حال ظهور است. تقسیم هسته سلول می تواند گامی مهم در این خط لوله پردازش تصویر باشد. اگر چه تقسیم بندی حوضه دانه دار روش تقسیم بندی ساده ، محاسباتی و کارآمد است، درزمان کاربرد برای تصاویر بافت شناسی در معرض خطاهایی از قبیل بیش از تقسیم بندی است. ما پیشرفتهای حاصل در این روش را برای بهبود تقسیم بندی هسته سلول در تصاویر بافت شناسی گزارش می دهیم. دانه های پیش زمینه با تبدیل سریع تقارن شعاعی ایجاد می شوند. آستانه اوتسو در تصویر ارتقا یافته به منظور برآورد نقشه پیش زمینه آزمایشی مورد استفاده قرار گرفت. نشانگر پس زمینه بر اساس نقشه پیش زمینه آزمایشی محاسبه شد. تشخیص غلط در خروجی تقسیم به وسیله AND منطقی با نقشه پیش زمینه آزمایشی برطرف شد. با استفاده از این پیشرفت ها ، تقسیم بندی هسته ای در تصاویر بافت شناسی به طور قابل توجهی بهبود یافت (تصاویر پستان و بافت روده رنگ آمیزی شده با روش هماتوکسیلین و ائوزین ، تصاویر بافت پروستات رنگ آمیزی شده با روش فولگن).
کلید واژه ها: تقسیم بندی حوضه دانه دار، تصاویر بافت شناسی، تقسیم بندی هسته سلول.
1-مقدمه
سرطان ، مسئله بهداشتی مهم در بسیاری از بخش های جهان است. سرطان های پستان، پروستات، ریه و روده بزرگ انواع پیشرو در تعداد موارد جدید تخمین زده شده و مرگ و میر هستند. عامل کاهش میزان مرگ و میر در سرطان ، تشخیص زود هنگام است. به طور معمول ، تشخیص نباید مثبت و منفی کاذب داشته باشد. بیوپسی، که شامل استخراج سلول ها از بافت مشکوک و بررسی آنها در زیر میکروسکوپ است، روشی بسیار دقیق اما تهاجمی برای تشخیص می باشد. تشخیص محاسباتی بر اساس نمونه ، زمینه پژوهشی در حال ظهور است. این نوع تشخیص می تواند ویژگی های بصری نامشخص را به تشخیص بالینی و نتایج آینده مرتبط سازد که در یک مطالعه اخیر نیز نشان داده شده است...